N-(9-芴基甲氧羰基)-L-半胱氨酸
[CAS 135248-89-4]

基本信息

• 产品分类: 生物化工 >> 氨基酸及其衍生物 >> 半胱氨酸类衍生物
• 产品名称: N-(9-芴基甲氧羰基)-L-半胱氨酸
• 英文名: N-(9-Fluorenylmethoxycarbonyl)-L-cysteine
• 别名: N-[(9H-Fluoren-9-ylmethoxy)carbonyl]-L-cysteine; Fmoc-L-Cys-OH; Fmoc-cysteine
• 分子式: C₁₈H₁₇NO₄S
• 分子量: 343.40
• 蛋白质序列: C
• CAS 登录号: 135248-89-4
• 分子行输入简码SMILES: C1=CC=C2C(=C1)C(C3=CC=CC=C32)COC(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O

物理化学性质

• 溶解度: 不溶 (8.9E^-3 g/L) (25 °C), 计算值^*
• 密度: 1.337±0.06 g/cm³ (20 °C 760 Torr), 计算值^*
• 沸点: 574.4±50.0 °C 760 mmHg (计算值)^*
• 闪点: 301.2±30.1 °C (计算值)^*
• 折射率: 1.634 (计算值)^*

^* 使用计算机软件 Advanced Chemistry Development (ACD/Labs) Software.

安全数据

• 危险品标志: GHS07 警告
• 危害标签: H302-H315-H319-H335
• 防护标签: P261-P305+P351+P338

chemBlink 化学品故事

保护氨基，并不等于保护氨基酸中所有活泼部位。N-(9-芴基甲氧羰基)-L-半胱氨酸（CAS 135248-89-4）清楚地展示了这一区别：α-氨基带 Fmoc，硫却仍是游离巯基。它与硫保护半胱氨酸衍生物之间的差别，代表可发生化学反应的变化，而不只是名称长短。

半胱氨酸的侧链为 CH₂SH。本 CAS 所对应结构中，氮上引入 Fmoc 后仍保留 S-H 键。因此，不能把它直接替代为 Fmoc-Cys(Trt)-OH、Fmoc-Cys(Acm)-OH 或其他硫上另有保护基的衍生物。这些都是分别定义的材料，在合成中的行为不同。

Fmoc 有明确的历史来源。1970 年，Louis Carpino 与 Grace Han 提出了芴甲氧羰基这一碱敏感氨基保护基。这解释了本分子临时氮保护的背景，并不表示该半胱氨酸 CAS 化合物首次发表于那篇论文。保护基的发明与采用它的每一种衍生物的历史，是不同问题。

游离巯基能够发生受保护硫在相同形式下不能进行的反应。两个巯基可氧化为二硫键，连接两个硫并改变分子连接关系；还原则可重新生成巯基。因此，样品氧化状态与实际组成有关。仅有氨基保护标签，不能证明所有硫仍以还原态单体存在。

在肽化学中，硫反应性可能是所需反应位点，也可能成为不希望的竞争途径。选择性标记与二硫键构建需要硫可参与反应，而许多链组装策略会先将其遮蔽，留待后续阶段。适合的衍生物取决于反应顺序；游离硫并不使该试剂成为常规 Fmoc 合成中所有侧链保护砌块的通用替代品。

半胱氨酸在活化、偶联时还需要关注立体化学。半胱氨酸肽合成技术文献讨论了特定条件下的差向异构化及其他副反应。这些问题与具体转化和底物有关，并不证明所有制备都会损失构型完整性。L-半胱氨酸通常为 R 构型，也说明不能将 L/D 自动翻译为 S/R。

该材料最有启发性的特点，是有选择地保留未保护部位：氮被刻意遮蔽，硫仍可利用。正确理解结构，既能看到合成机会，也能明确需要通过分析将目标化合物与氧化产物及其他保护衍生物区分开来。

参考文献：
1. PubChem. Fmoc-L-cysteine, CID 11024349; CAS 135248-89-4 and free-thiol structure. https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/11024349
2. Carpino LA, Han GY. The 9-Fluorenylmethoxycarbonyl Function, a New Base-Sensitive Amino-Protecting Group. JACS (1970). https://doi.org/10.1021/ja00722a043
3. Merck/Novabiochem. Protocols for the Fmoc SPPS of Cysteine-Containing Peptides. https://www.sigmaaldrich.com/BI/en/technical-documents/protocol/chemistry-and-synthesis/peptide-synthesis/fmoc-spps-cysteine-peptides

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